Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLIP1P30622 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms