Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5DP30049 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms