Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms