Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMLP26374 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHMLP26374 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms