Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms