Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HRCP23327 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HRCP23327 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HRCP23327 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HRCP23327 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HRCP23327 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HRCP23327 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HRCP23327 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms