Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms