Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD58P19256 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD58P19256 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD58P19256 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD58P19256 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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