Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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