Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGFBP3P17936 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGFBP3P17936 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms