Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms