Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms