Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms