Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH1P12830 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH1P12830 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms