Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms