Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A1P11836 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A1P11836 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms