Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms