Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms