Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGAP02671 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGAP02671 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGAP02671 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGAP02671 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGAP02671 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGAP02671 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGAP02671 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGAP02671 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms