Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC1P02654 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms