Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms