Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP4O75379 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms