Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPNO60542 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms