Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF14O43557 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF14O43557 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms