Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COCHO43405 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COCHO43405 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COCHO43405 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COCHO43405 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms