Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms