Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASKO14936 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASKO14936 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASKO14936 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASKO14936 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASKO14936 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASKO14936 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASKO14936 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASKO14936 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1609.3 ms