Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms