Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23AA6NH52 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms