Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms