Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms