Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPRKBQ9Y3C4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPRKBQ9Y3C4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms