Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC12A4Q9UP95 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC12A4Q9UP95 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms