Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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