Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms