Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms