Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYTH4Q9UIA0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms