Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DKK2Q9UBU2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms