Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms