Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms