Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms