Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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