Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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FAM53CQ9NYF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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