Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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