Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms