Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCM2LQ9NUG4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms