Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms