Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms