Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX15Q9NRS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms