Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4GALTQ9NPC4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4GALTQ9NPC4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms